124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0524 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  100 
 
 
637 aa  1273    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  56.21 
 
 
679 aa  709    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  52.17 
 
 
647 aa  620  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  51.12 
 
 
646 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  39.35 
 
 
691 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  39.07 
 
 
696 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  38.92 
 
 
696 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  35.21 
 
 
660 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  35.3 
 
 
634 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  35.46 
 
 
634 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  35.49 
 
 
639 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  35.49 
 
 
639 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  35.34 
 
 
639 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  43.87 
 
 
696 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  33.72 
 
 
572 aa  191  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  33.75 
 
 
422 aa  186  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.43 
 
 
653 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  29.78 
 
 
396 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  31.3 
 
 
645 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  30.39 
 
 
683 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.53 
 
 
603 aa  151  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  29.86 
 
 
652 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  28.77 
 
 
653 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25.92 
 
 
637 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  29.23 
 
 
413 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.61 
 
 
556 aa  140  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  29.13 
 
 
642 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  29.13 
 
 
642 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  31.52 
 
 
640 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  27.42 
 
 
636 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  31.85 
 
 
273 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  29.57 
 
 
647 aa  125  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  30.2 
 
 
640 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  29.34 
 
 
642 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  27.51 
 
 
633 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  27.15 
 
 
647 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  26.34 
 
 
647 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  30.17 
 
 
643 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.49 
 
 
644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  29.44 
 
 
652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  26.78 
 
 
631 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.79 
 
 
657 aa  117  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  27.3 
 
 
652 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  29.72 
 
 
649 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  27.2 
 
 
632 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  27.92 
 
 
664 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  26.7 
 
 
632 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  30.28 
 
 
570 aa  107  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  30.28 
 
 
570 aa  107  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  26.63 
 
 
629 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  27.82 
 
 
399 aa  97.8  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  32.02 
 
 
279 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  26.02 
 
 
743 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  30.81 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  27.16 
 
 
820 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  25.12 
 
 
779 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  26.87 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  36.17 
 
 
702 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  32.65 
 
 
281 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  32.69 
 
 
276 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  32.05 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  28.44 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  29.44 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  25.57 
 
 
846 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  34.06 
 
 
284 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  27 
 
 
782 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.81 
 
 
294 aa  65.1  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  30.77 
 
 
279 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  31.98 
 
 
281 aa  64.3  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  25.96 
 
 
308 aa  64.3  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  29.58 
 
 
278 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  30.51 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  27.37 
 
 
283 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  27.23 
 
 
287 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  30.1 
 
 
282 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  30.1 
 
 
285 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  30.1 
 
 
282 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  27 
 
 
677 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  27.04 
 
 
283 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  28.86 
 
 
284 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  32.58 
 
 
279 aa  58.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  30.66 
 
 
280 aa  57.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  30.37 
 
 
579 aa  57.4  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  27.63 
 
 
294 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  27.98 
 
 
277 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  30.32 
 
 
314 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  32.14 
 
 
303 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  28.07 
 
 
291 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  29.29 
 
 
281 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  32.14 
 
 
303 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  31.47 
 
 
308 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  30.15 
 
 
537 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  27.09 
 
 
281 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  24.22 
 
 
379 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  32.39 
 
 
277 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  27.32 
 
 
278 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  26.18 
 
 
288 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  31.25 
 
 
315 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  34.03 
 
 
315 aa  52  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>