159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3898 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  100 
 
 		 537 aa  1035    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  46.36 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  62.45 
 
 		 283 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  59.62 
 
 		 277 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  43.61 
 
 		 281 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  41.87 
 
 		 282 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  41.52 
 
 		 285 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  41.52 
 
 		 282 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  42.48 
 
 		 281 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  47.47 
 
 		 278 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  43.14 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  44.75 
 
 		 304 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  44.02 
 
 		 294 aa  190  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  48.46 
 
 		 278 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  41.64 
 
 		 277 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  39.55 
 
 		 280 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  41.95 
 
 		 276 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  41.95 
 
 		 276 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  41.95 
 
 		 276 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  41.95 
 
 		 276 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  41.95 
 
 		 276 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  41.95 
 
 		 279 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  41.57 
 
 		 276 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  41.64 
 
 		 281 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  45.86 
 
 		 281 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  43.08 
 
 		 284 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  39.71 
 
 		 281 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  44.4 
 
 		 289 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  42.31 
 
 		 284 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  38.03 
 
 		 290 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  38.52 
 
 		 287 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  41.9 
 
 		 290 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  42.59 
 
 		 279 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  41.15 
 
 		 291 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  38.64 
 
 		 691 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  38.29 
 
 		 284 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  39.22 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  38.76 
 
 		 702 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  38.7 
 
 		 294 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  38.97 
 
 		 315 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  32.4 
 
 		 303 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  37.5 
 
 		 314 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  34.4 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  30.92 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  36.99 
 
 		 315 aa  126  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  38.99 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 303 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  35.96 
 
 		 303 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  34.59 
 
 		 280 aa  120  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  29.59 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  40.22 
 
 		 308 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  39.91 
 
 		 305 aa  117  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  36.28 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  31.79 
 
 		 308 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  34.1 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  29.3 
 
 		 280 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 280 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 280 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  29.3 
 
 		 280 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  31.18 
 
 		 280 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  31.37 
 
 		 280 aa  90.1  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 280 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  29.09 
 
 		 280 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 280 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  33.17 
 
 		 634 aa  87.8  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  33.18 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  34.03 
 
 		 634 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  29.38 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  32.26 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  32.26 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  30.43 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  28.92 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.64 
 
 		 653 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  29.85 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  30.32 
 
 		 281 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  32.48 
 
 		 279 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  31.18 
 
 		 277 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  30.18 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  30.18 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.26 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  27.49 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  34.18 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  31.56 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  34.18 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  34.18 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  30.19 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  31.16 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  31.55 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  31.98 
 
 		 572 aa  73.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  31.07 
 
 		 636 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.07 
 
 		 632 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2103  Iron permease FTR1  27.96 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  30.65 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 631 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>