206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3403 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  100 
 
 		 702 aa  1373    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  51.57 
 
 		 691 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  42.45 
 
 		 677 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  43.66 
 
 		 438 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  41.95 
 
 		 400 aa  257  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  48.31 
 
 		 291 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  46.47 
 
 		 294 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  47.74 
 
 		 290 aa  233  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  47.97 
 
 		 303 aa  230  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  44.53 
 
 		 287 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  48.7 
 
 		 294 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  46.36 
 
 		 281 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  45.25 
 
 		 284 aa  210  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  47.77 
 
 		 304 aa  210  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  41.01 
 
 		 304 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  35.59 
 
 		 304 aa  154  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  37.02 
 
 		 290 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  34.38 
 
 		 281 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  35.97 
 
 		 280 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  37.26 
 
 		 283 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  37.77 
 
 		 283 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  38.76 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  33.7 
 
 		 281 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  37.12 
 
 		 278 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  32.84 
 
 		 281 aa  134  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  35.98 
 
 		 278 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  35.27 
 
 		 284 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  35.53 
 
 		 279 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  34.18 
 
 		 277 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  35.17 
 
 		 289 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  38.73 
 
 		 277 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  33.98 
 
 		 282 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  33.98 
 
 		 285 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  33.98 
 
 		 282 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  34.69 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  34.4 
 
 		 281 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  26.25 
 
 		 373 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  32.96 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  32.23 
 
 		 279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  32.58 
 
 		 276 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  32.58 
 
 		 276 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  32.58 
 
 		 276 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  32.58 
 
 		 276 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  32.58 
 
 		 276 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  26.42 
 
 		 402 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  26.18 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  30.14 
 
 		 386 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  25.65 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  25.65 
 
 		 376 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  25.13 
 
 		 376 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  25.13 
 
 		 374 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  37.26 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  25.58 
 
 		 371 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  24.43 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  27.41 
 
 		 375 aa  107  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  107  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  107  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  107  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  23.85 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  23.56 
 
 		 375 aa  105  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  23.34 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  37.81 
 
 		 634 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  31.51 
 
 		 373 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  25.61 
 
 		 376 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  28.19 
 
 		 393 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  35.77 
 
 		 280 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  26.75 
 
 		 395 aa  96.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  37.23 
 
 		 308 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  34.1 
 
 		 315 aa  97.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  27.52 
 
 		 396 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  32.39 
 
 		 314 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  29.93 
 
 		 385 aa  94.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  26.38 
 
 		 272 aa  94.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  32.26 
 
 		 308 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  33.64 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  33.64 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  33.64 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  25.91 
 
 		 278 aa  91.3  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  27.67 
 
 		 385 aa  91.3  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  32.87 
 
 		 315 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  26.1 
 
 		 375 aa  90.9  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  26.05 
 
 		 274 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  24.93 
 
 		 375 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  33.08 
 
 		 279 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  30.55 
 
 		 280 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  24.85 
 
 		 396 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  29.93 
 
 		 307 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  30.55 
 
 		 280 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  28.62 
 
 		 409 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  28.91 
 
 		 385 aa  89.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  23.99 
 
 		 387 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  30.22 
 
 		 280 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  34.45 
 
 		 417 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  25.07 
 
 		 399 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  26.44 
 
 		 275 aa  87.8  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  30.71 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>