21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03387 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03387  iron permease, FTR1 family protein  100 
 
 
253 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0641  hypothetical protein  39.08 
 
 
252 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2783  hypothetical protein  28.95 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  36.36 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3306  iron permease FTR1  35.56 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  32.81 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  48.65 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  47.37 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  32.81 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  32.81 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  32.81 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  32.81 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  23.27 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3034  iron permease FTR1  30.77 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  29.69 
 
 
281 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>