90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2320 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  100 
 
 		 702 aa  1427    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  100 
 
 		 702 aa  1427    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  27.24 
 
 		 395 aa  91.3  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  30.14 
 
 		 388 aa  87.8  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  27.21 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  26.86 
 
 		 394 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  26.86 
 
 		 394 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  26.28 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  27.81 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.9 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  33.33 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 636 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  33.33 
 
 		 632 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  32.04 
 
 		 633 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  39.22 
 
 		 254 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  25 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  32.67 
 
 		 629 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  25 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  32.04 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  25.98 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  24.82 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  35.58 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  24.83 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  25.93 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  29.13 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  31.13 
 
 		 644 aa  62  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.91 
 
 		 329 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  32.08 
 
 		 649 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  36.11 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.18 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  31.13 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  25.19 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  25.19 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  30.33 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.91 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  33.03 
 
 		 643 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 683 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  23.81 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25.51 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30.21 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  29.44 
 
 		 296 aa  55.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 156 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 207 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  35.19 
 
 		 293 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  26.45 
 
 		 166 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  28.95 
 
 		 200 aa  51.2  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  28.45 
 
 		 398 aa  51.2  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 546 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  29.03 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  26.25 
 
 		 652 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  29.63 
 
 		 190 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  40.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 214 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  31.63 
 
 		 151 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  25.86 
 
 		 177 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  31.58 
 
 		 434 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  27.84 
 
 		 373 aa  48.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  39.19 
 
 		 571 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  32.94 
 
 		 181 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  26.83 
 
 		 204 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 174 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  28 
 
 		 190 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 128 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.55 
 
 		 153 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000836968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  28.41 
 
 		 203 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  28 
 
 		 190 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  32.86 
 
 		 166 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  25.47 
 
 		 175 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  31.33 
 
 		 170 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  28.43 
 
 		 155 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.12 
 
 		 231 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  31.48 
 
 		 173 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  26.21 
 
 		 175 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  37.31 
 
 		 212 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  27 
 
 		 309 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 450 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  32.38 
 
 		 314 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  27.55 
 
 		 213 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  25.24 
 
 		 209 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  28.16 
 
 		 220 aa  45.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 560 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.32 
 
 		 189 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  31.87 
 
 		 535 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.15 
 
 		 298 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>