67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4349 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  29.79 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  29.3 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  29.31 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  28.9 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  30.07 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  29.78 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  28.21 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  32.03 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  28.14 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  28.14 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  30.49 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  28.14 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  31.78 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  30.61 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  25.66 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  27.17 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  25.66 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  24.04 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  29.61 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  28.07 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  25 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  26.17 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.93 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.1 
 
 		 395 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  24.68 
 
 		 414 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  27.06 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  23.85 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  27.27 
 
 		 414 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 394 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  29.81 
 
 		 394 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  26.32 
 
 		 644 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  26.61 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  29.03 
 
 		 878 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  25.36 
 
 		 649 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  30.53 
 
 		 394 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  30.53 
 
 		 394 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  29 
 
 		 393 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 388 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  28 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  27.17 
 
 		 393 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  24.03 
 
 		 346 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 388 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 388 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  27.72 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  27.72 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  24.84 
 
 		 640 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.91 
 
 		 339 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  26.26 
 
 		 546 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.91 
 
 		 339 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  24.79 
 
 		 632 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  22.46 
 
 		 631 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  27.96 
 
 		 209 aa  41.6  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1890  cytochrome c550  26 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.91 
 
 		 339 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  26.56 
 
 		 642 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  26.56 
 
 		 642 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  27.19 
 
 		 224 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2257  cytochrome c550  23.53 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>