45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0699 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  92.35 
 
 
197 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  90.75 
 
 
212 aa  333  9e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  50 
 
 
191 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  45.6 
 
 
186 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  47.31 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  44.64 
 
 
260 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  48.97 
 
 
259 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  48.97 
 
 
259 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  48.97 
 
 
259 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  45.7 
 
 
260 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  41.76 
 
 
257 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  39.81 
 
 
209 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  36.57 
 
 
205 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  36 
 
 
206 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  40 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  36.63 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  35.12 
 
 
174 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  35.67 
 
 
293 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  36.31 
 
 
212 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  34.34 
 
 
379 aa  104  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  33.14 
 
 
199 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  34.67 
 
 
382 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  36.91 
 
 
373 aa  95.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  32.65 
 
 
170 aa  92  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  34.32 
 
 
212 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  29.94 
 
 
414 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  28.9 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  29.45 
 
 
414 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  33.88 
 
 
156 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  29.67 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  27.55 
 
 
878 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  30.97 
 
 
254 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  28.87 
 
 
394 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  25.25 
 
 
653 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  31.18 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.04 
 
 
640 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  31.31 
 
 
640 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.84 
 
 
394 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.84 
 
 
394 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  27.84 
 
 
394 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  25.51 
 
 
393 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  31.07 
 
 
642 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  31.07 
 
 
642 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>