47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1034 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  82.08 
 
 		 212 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  32.32 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  37.65 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  33.82 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  36.81 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  39.87 
 
 		 181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 414 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  36.59 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  34.73 
 
 		 293 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  35.37 
 
 		 373 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  34.43 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  35.37 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  35.54 
 
 		 414 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  33.98 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 379 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  32.72 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  32.72 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  31.75 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  32.72 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  36.69 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  34.32 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  35.12 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  31.86 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  35.59 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 382 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  33.16 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  36.46 
 
 		 878 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  31.11 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  40.79 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 702 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 702 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  24 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.58 
 
 		 653 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  34.15 
 
 		 394 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  34.18 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.87 
 
 		 546 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  34.15 
 
 		 394 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.35 
 
 		 637 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  34.15 
 
 		 394 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  31.71 
 
 		 556 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  34.85 
 
 		 629 aa  41.6  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>