94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0225 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  49.24 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  46.07 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  42.13 
 
 		 499 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  45.18 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  45.71 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  45.14 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  45.14 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  37.1 
 
 		 477 aa  134  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  41.81 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  43.92 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  34.29 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  40.11 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  40.72 
 
 		 190 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  38.61 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  49.51 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  39.41 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  38.65 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  38.41 
 
 		 175 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  47.17 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  38.12 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  37.11 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  38.18 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  33.69 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  27.37 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  30.41 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  26.6 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  30.14 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  29.87 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  33.73 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  33.02 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  29.92 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  34.21 
 
 		 645 aa  61.6  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.28 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 393 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  30 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  30 
 
 		 393 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  30.88 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  30 
 
 		 394 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  30.39 
 
 		 546 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  38.33 
 
 		 657 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  40 
 
 		 647 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  27.55 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 128 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  32.95 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  28.46 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  33.67 
 
 		 631 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 647 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31 
 
 		 388 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 128 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  32.35 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  31.63 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  35.56 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  31.91 
 
 		 132 aa  48.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  30.33 
 
 		 632 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 636 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30.63 
 
 		 647 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  34.23 
 
 		 633 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 388 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  25.24 
 
 		 702 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  25.24 
 
 		 702 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 388 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  33 
 
 		 629 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  34.26 
 
 		 254 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  34.74 
 
 		 664 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.5 
 
 		 637 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  27.55 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  28.93 
 
 		 632 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  33.64 
 
 		 652 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  31.19 
 
 		 643 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 382 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3734  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  26.96 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  27.59 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  29.35 
 
 		 119 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  27.2 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  27.96 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  31.63 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  31.13 
 
 		 649 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  29.9 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>