60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2209 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  39.05 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  40.11 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  34.87 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  34.02 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  31.68 
 
 		 231 aa  96.3  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  36.57 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.87 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  31.58 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  36.26 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  31.06 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  32.37 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  27.69 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  30.08 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  27.69 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  36.05 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  30.66 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  27.7 
 
 		 499 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  28.97 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  33.02 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  28.47 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  29.93 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  29.2 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  25.52 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  24.2 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  24.81 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  28.24 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  27.48 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  27.48 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 644 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  26.37 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.59 
 
 		 645 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  30.25 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 647 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  27.01 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30.93 
 
 		 652 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 636 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  26.67 
 
 		 649 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  28.41 
 
 		 647 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  27.17 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25.53 
 
 		 546 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.37 
 
 		 477 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 642 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  27.45 
 
 		 643 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 642 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  29.35 
 
 		 640 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  26.28 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.02 
 
 		 298 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  27.27 
 
 		 642 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  27.83 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  30.39 
 
 		 629 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  28.89 
 
 		 652 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>