99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3985 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  983    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  38.8 
 
 		 499 aa  316  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  46.24 
 
 		 217 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  43.37 
 
 		 181 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  38.22 
 
 		 209 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  40.68 
 
 		 192 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  36.16 
 
 		 218 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  43.71 
 
 		 192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  38.12 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  38.89 
 
 		 180 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  38.37 
 
 		 186 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  37.21 
 
 		 181 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  38.69 
 
 		 179 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  33.78 
 
 		 205 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  31.63 
 
 		 213 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  31.46 
 
 		 205 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  31.92 
 
 		 212 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  34.68 
 
 		 175 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  35.86 
 
 		 175 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.24 
 
 		 175 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.11 
 
 		 175 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  36.09 
 
 		 197 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  29.27 
 
 		 172 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  31 
 
 		 193 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  39.09 
 
 		 173 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  31.84 
 
 		 194 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  37.96 
 
 		 194 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  32.76 
 
 		 176 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  37.19 
 
 		 190 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  37.19 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  37.19 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  36.52 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  26.25 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  36.75 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  31.74 
 
 		 177 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  30.35 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  38.33 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  32.14 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  30.68 
 
 		 174 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  29.47 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  34.32 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  31.74 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  33.1 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  37.27 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  30.54 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  37.27 
 
 		 175 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  31.2 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  31.82 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  34.27 
 
 		 175 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  28.82 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  33.09 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  27.39 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  31.37 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  31.68 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  31.15 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  31.3 
 
 		 645 aa  57  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.17 
 
 		 653 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2663  hypothetical protein  33.61 
 
 		 224 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  30 
 
 		 702 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  30 
 
 		 702 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  29.7 
 
 		 231 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  28.7 
 
 		 664 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 643 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 220 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  28.45 
 
 		 143 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 657 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  28.74 
 
 		 128 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  27.13 
 
 		 166 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  32.35 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  32.35 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  29.13 
 
 		 151 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  31.37 
 
 		 394 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  27.72 
 
 		 156 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  29.29 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  31.13 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  26.36 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.13 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  31.15 
 
 		 653 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  25.35 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  27.81 
 
 		 647 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  26.67 
 
 		 624 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.74 
 
 		 637 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  26.11 
 
 		 624 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2774  hypothetical protein  26.89 
 
 		 194 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>