53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6890 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  87.26 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  66.67 
 
 		 173 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  62.66 
 
 		 175 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  62.03 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  58.29 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  58.97 
 
 		 175 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  43.46 
 
 		 213 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  45.76 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  47.77 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  43.98 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  46.3 
 
 		 201 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  46.15 
 
 		 195 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  44.24 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  38.25 
 
 		 205 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  38.61 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  50.78 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  37.11 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  37.06 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  36.09 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  40.13 
 
 		 499 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  39.62 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  39.62 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  39.24 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  38.79 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  29.27 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  29.57 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  33.02 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  27.43 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  28.18 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.19 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25.15 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  32.38 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 645 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  31.25 
 
 		 664 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  36.71 
 
 		 647 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  24.39 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.4 
 
 		 637 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  29.91 
 
 		 320 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  31.87 
 
 		 643 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 220 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  28.12 
 
 		 181 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  27.16 
 
 		 100 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 401 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 401 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  29.41 
 
 		 373 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 657 aa  40.8  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>