74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1592 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  100 
 
 
205 aa  427  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  54.95 
 
 
218 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  44.5 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  41.04 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  40.21 
 
 
499 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  42.77 
 
 
175 aa  141  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  46.15 
 
 
172 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  41.99 
 
 
201 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  42.17 
 
 
175 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  42.17 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  40.74 
 
 
209 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  40.76 
 
 
175 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  42.77 
 
 
194 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  38.12 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  41.95 
 
 
175 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  41.92 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  37.85 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  37.29 
 
 
190 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  37.29 
 
 
190 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  39.52 
 
 
212 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  39.25 
 
 
193 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  36.52 
 
 
190 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  38.01 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  32.14 
 
 
200 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  28.65 
 
 
185 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.46 
 
 
477 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  29.28 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30.59 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  29.86 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  27.96 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  29.66 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  34.78 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  27.39 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  28.45 
 
 
151 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  28.04 
 
 
394 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  28.04 
 
 
394 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  28.04 
 
 
394 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  27.27 
 
 
394 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  26.42 
 
 
393 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  31.25 
 
 
652 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  27.18 
 
 
393 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  28 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  24.34 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  33.33 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  30.95 
 
 
143 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  33.71 
 
 
132 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.23 
 
 
637 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  31.4 
 
 
645 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  25.96 
 
 
395 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  30.17 
 
 
643 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.41 
 
 
546 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  28.72 
 
 
156 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  26.44 
 
 
277 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.27 
 
 
644 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  25.24 
 
 
393 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  23.53 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  25.25 
 
 
388 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  24 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  25.25 
 
 
388 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05630  hypothetical protein  29 
 
 
472 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  26.47 
 
 
702 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  26.47 
 
 
702 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  26.6 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  27.64 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  28.32 
 
 
254 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
268 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  30 
 
 
649 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  31.46 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  30.95 
 
 
136 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  29.21 
 
 
640 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32 
 
 
653 aa  41.6  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>