94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4143 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  83.51 
 
 		 193 aa  340  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  42.77 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  47.8 
 
 		 209 aa  124  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  41.57 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  39.34 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  39.26 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  39.38 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  39.35 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  38.42 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  40.13 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  40.13 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  40.13 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  36.42 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  38.82 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  36.08 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  36.62 
 
 		 173 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  39.07 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  39.07 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  40.44 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  39.42 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  32.54 
 
 		 499 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  32.84 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  32.34 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  33.09 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  38.71 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.04 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  34.75 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  32.98 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  24.6 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  25.64 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  24.85 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  31.63 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  35.79 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.13 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 393 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  31 
 
 		 393 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  28.47 
 
 		 643 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  27.97 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  28.71 
 
 		 393 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 394 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  30.63 
 
 		 644 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 293 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.32 
 
 		 388 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.32 
 
 		 388 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 649 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  30.93 
 
 		 398 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  34.38 
 
 		 664 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  31.96 
 
 		 647 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  31.46 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  27.06 
 
 		 100 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 647 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  29.52 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 647 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  29 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  30.85 
 
 		 636 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  34.34 
 
 		 511 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  31.25 
 
 		 653 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  27.01 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  26.87 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 101 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.87 
 
 		 637 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 657 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  28.24 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  35.63 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  28.03 
 
 		 640 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.29 
 
 		 632 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  28.43 
 
 		 546 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  26.62 
 
 		 642 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  25.14 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  28.06 
 
 		 642 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  34.44 
 
 		 632 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  30.11 
 
 		 525 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  28.06 
 
 		 642 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  26.13 
 
 		 350 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 366 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 374 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1186  hypothetical protein  34.15 
 
 		 127 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222804  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 171 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  35.53 
 
 		 356 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 374 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  30.11 
 
 		 640 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  26.37 
 
 		 418 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  26.37 
 
 		 418 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  26.37 
 
 		 390 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>