86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2415 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1030    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  38.19 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  52.05 
 
 		 192 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  52.05 
 
 		 192 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  46.29 
 
 		 217 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  47.24 
 
 		 180 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  44.12 
 
 		 181 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  40.76 
 
 		 205 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  46.47 
 
 		 218 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  42.05 
 
 		 209 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  41.52 
 
 		 179 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  39.02 
 
 		 212 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  43.75 
 
 		 181 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  39.13 
 
 		 180 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  37.1 
 
 		 205 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  37.29 
 
 		 201 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  43.24 
 
 		 197 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  41.24 
 
 		 190 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  37.28 
 
 		 186 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  42.37 
 
 		 213 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  37.41 
 
 		 175 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  36.59 
 
 		 176 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  35.23 
 
 		 178 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.49 
 
 		 175 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.36 
 
 		 175 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  36.16 
 
 		 176 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  41.03 
 
 		 195 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  39.88 
 
 		 172 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  35.12 
 
 		 173 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  35.33 
 
 		 177 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  35.81 
 
 		 175 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  37.01 
 
 		 175 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  34.52 
 
 		 176 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  33.74 
 
 		 175 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  37.35 
 
 		 176 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  41.88 
 
 		 185 aa  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  35.47 
 
 		 190 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  39.45 
 
 		 194 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  38.31 
 
 		 175 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  34.52 
 
 		 177 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  30.72 
 
 		 174 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  29.7 
 
 		 172 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  30.23 
 
 		 174 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  32.93 
 
 		 193 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  32.54 
 
 		 194 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  32.24 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  29.94 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  28.99 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.68 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  28.24 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  32.12 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  29.29 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  33.57 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  29.25 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  36.27 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  31.33 
 
 		 172 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.83 
 
 		 231 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25.3 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  30.1 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  30.85 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  29.2 
 
 		 393 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  29.2 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  30.1 
 
 		 166 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  30 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  28.32 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  28.32 
 
 		 394 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 143 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  28.32 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  28.32 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  28.1 
 
 		 203 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  31.34 
 
 		 624 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  33.01 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  32.35 
 
 		 624 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  31.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.164665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.47 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 546 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  23.42 
 
 		 702 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  23.42 
 
 		 702 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>