54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1638 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  51.91 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  48.21 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  34.02 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  37.21 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  31.09 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  33.57 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  30.67 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  31.65 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  27.68 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  28.41 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  29.35 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  27.34 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  29.53 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  28.67 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  34.78 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  27.39 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  26.85 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  27.92 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  25.68 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  25.68 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  25.3 
 
 		 499 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  30.11 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  23.66 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  26.17 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  24.6 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  26 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  22.78 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  31.14 
 
 		 718 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  23.47 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  24.72 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.17 
 
 		 306 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  25.98 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.71 
 
 		 307 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.15 
 
 		 723 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  24.86 
 
 		 326 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  24.71 
 
 		 307 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  25 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  23.57 
 
 		 312 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  23.81 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  25.29 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 104 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.86 
 
 		 296 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  25.58 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.3 
 
 		 313 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0640  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  25.84 
 
 		 317 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00144389  normal  0.731744 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 254 aa  41.2  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25 
 
 		 308 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  34.09 
 
 		 645 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>