59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1041 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  45.24 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  43.42 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  43.42 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  35 
 
 		 205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  50.78 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  39.41 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  37.2 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  42.67 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  40.96 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  45.54 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  38.16 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  38.02 
 
 		 195 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  41.72 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  33.65 
 
 		 499 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  37.71 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  31.02 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  35.67 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  34.34 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  35.76 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  35.76 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  35.76 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  36.75 
 
 		 477 aa  71.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  31.14 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  25.86 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  38.71 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  28 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  34.02 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  25.85 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  26.11 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  29.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  33.71 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 395 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  34.91 
 
 		 388 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  33 
 
 		 393 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25.98 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  31.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 393 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  28.05 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31 
 
 		 546 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 254 aa  44.3  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  30.12 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  32 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  31 
 
 		 394 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  34.07 
 
 		 645 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  29.76 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  34.04 
 
 		 254 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 388 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30.58 
 
 		 388 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  36.36 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  31 
 
 		 394 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3734  hypothetical protein  35.05 
 
 		 132 aa  40.8  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  33.96 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>