58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5952 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  50.62 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  51.3 
 
 		 175 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  50.65 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  52.35 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  50.35 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  47.22 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  39.32 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  39.34 
 
 		 195 aa  137  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  49.3 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  42.37 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  43.03 
 
 		 201 aa  127  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  43.03 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  38.74 
 
 		 205 aa  120  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  37.42 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  39.04 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  36.84 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  38.12 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  37.79 
 
 		 190 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  37.79 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  37.79 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  37.42 
 
 		 190 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  35 
 
 		 200 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  34.36 
 
 		 499 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  35.06 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  33.53 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  28.41 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  30.35 
 
 		 477 aa  68.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  27.69 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  26.14 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  29.7 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  25.32 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  27.72 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  26.49 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  26.28 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  34.58 
 
 		 645 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  31.15 
 
 		 394 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  31.15 
 
 		 394 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  27.1 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  30.33 
 
 		 394 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  30.33 
 
 		 394 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 393 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.31 
 
 		 637 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  28.81 
 
 		 393 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.61 
 
 		 653 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  33.7 
 
 		 643 aa  44.7  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 657 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  29.47 
 
 		 398 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  27.2 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  35.85 
 
 		 664 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  26.67 
 
 		 629 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 		 520 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 631 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  28.71 
 
 		 393 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 311 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>