100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5668 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  100 
 
 		 203 aa  426  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  67.96 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  39.05 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  35.03 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  31.09 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  28.86 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  29.61 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  35.51 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  42.35 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  34.51 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  29.38 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  33.67 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  33.09 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  34.78 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  33.01 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  32.88 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  26.83 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  31.72 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  32.63 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  32.69 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  31.51 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  32.63 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  32.65 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  34.15 
 
 		 175 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  27.5 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  24.76 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  29.2 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  32.1 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  31.36 
 
 		 393 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  33.05 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  31.33 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  32.1 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  31.68 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  31.19 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  30.47 
 
 		 640 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  29.92 
 
 		 642 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  29.92 
 
 		 642 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  30.51 
 
 		 394 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  30.51 
 
 		 394 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  28.1 
 
 		 499 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  29.29 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  28.81 
 
 		 394 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  35.71 
 
 		 652 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 395 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  29.46 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  32.14 
 
 		 642 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  26.67 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  28.23 
 
 		 640 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  27.45 
 
 		 101 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 388 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.76 
 
 		 644 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  27.97 
 
 		 393 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  25.96 
 
 		 398 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  29.07 
 
 		 649 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 101 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  54.55 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.33 
 
 		 637 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 702 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 702 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2405  cytochrome c class I  33.8 
 
 		 100 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  31.13 
 
 		 653 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  26.73 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  32.67 
 
 		 477 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  32.14 
 
 		 664 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  28.57 
 
 		 643 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 647 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  31.33 
 
 		 645 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25.81 
 
 		 546 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  26.47 
 
 		 718 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  32.84 
 
 		 388 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  32.84 
 
 		 388 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.95 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.11 
 
 		 422 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 571 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.95 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  29.67 
 
 		 615 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  24.07 
 
 		 293 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.67 
 
 		 653 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.96 
 
 		 732 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  28.44 
 
 		 224 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 100 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  51.52 
 
 		 430 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  29.11 
 
 		 652 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  40 
 
 		 432 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 647 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 647 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>