50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0832 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  42.38 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  44 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  42.48 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  44 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  45.33 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  46.6 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  42.28 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  42.96 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  43.66 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  51.92 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  31.47 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  45 
 
 		 218 aa  94.4  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  41.88 
 
 		 499 aa  91.3  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  31.72 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  37.67 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  39.13 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  35.15 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  35.15 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  40.91 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  35.15 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  34 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  36.63 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  34.78 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  29.45 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.82 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  28.45 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  25.69 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.46 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  34 
 
 		 640 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  27.38 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  26.15 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  31.58 
 
 		 329 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.53 
 
 		 339 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25.58 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  33.67 
 
 		 642 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  33.67 
 
 		 642 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  33.7 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  38.55 
 
 		 647 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  32.67 
 
 		 640 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>