61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4184 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  357  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  66.67 
 
 		 172 aa  227  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  59.43 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  62.66 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  60.76 
 
 		 175 aa  200  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  62.42 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  62.42 
 
 		 175 aa  197  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  45.28 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  41.44 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  43.21 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  42.17 
 
 		 205 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  43.21 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  41.38 
 
 		 195 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  39.78 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  37.95 
 
 		 212 aa  107  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  47.17 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  38.26 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  39.39 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  39.39 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  38.79 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  97.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  34.64 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  35.33 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  37.35 
 
 		 190 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  34.13 
 
 		 194 aa  90.9  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  29.89 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  34.51 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  40.91 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  34.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  30.08 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  26.74 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  26.8 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  28.36 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  31.58 
 
 		 645 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  32.04 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 657 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.85 
 
 		 653 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 702 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 702 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  32.35 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.75 
 
 		 637 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  34.34 
 
 		 138 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  29.03 
 
 		 643 aa  44.7  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  30.33 
 
 		 664 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  26.05 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  27.27 
 
 		 394 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  24.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  28 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 546 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  32.08 
 
 		 314 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  26.26 
 
 		 394 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  26.26 
 
 		 394 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  30.1 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  32.28 
 
 		 647 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  31.4 
 
 		 649 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>