91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0851 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  99.47 
 
 
190 aa  383  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  99.47 
 
 
190 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  71.76 
 
 
190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  45.14 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  44.71 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  44.57 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  37.29 
 
 
205 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  40.1 
 
 
205 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  49.21 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  45.71 
 
 
201 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  41.99 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  41.81 
 
 
499 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  41.11 
 
 
195 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  41.14 
 
 
175 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  39.39 
 
 
173 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  40.51 
 
 
175 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  41.32 
 
 
193 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  37.36 
 
 
175 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  40.51 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  40.13 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  37.13 
 
 
212 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  36.54 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  35.76 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  34.07 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  37.19 
 
 
477 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  28.49 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.21 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  32.88 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25.68 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.08 
 
 
177 aa  57.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  27.01 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  35.14 
 
 
647 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  29.73 
 
 
394 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  30 
 
 
394 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  29.81 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  30 
 
 
393 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  30 
 
 
393 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  28.42 
 
 
394 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  28.42 
 
 
394 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  29.91 
 
 
393 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  34.29 
 
 
643 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  27.48 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  34.83 
 
 
649 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  31.18 
 
 
379 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.04 
 
 
702 aa  48.5  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.04 
 
 
702 aa  48.5  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.63 
 
 
546 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  29.52 
 
 
395 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31.13 
 
 
388 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  27.27 
 
 
314 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.4 
 
 
420 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  35.56 
 
 
254 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  36.56 
 
 
645 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1219  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  31.54 
 
 
343 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.983776  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  31.82 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  31.62 
 
 
420 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  31.19 
 
 
296 aa  46.2  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  31.11 
 
 
644 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  26.73 
 
 
388 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.77 
 
 
418 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  26.73 
 
 
388 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  32.04 
 
 
664 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  29.41 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  31.96 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.25 
 
 
349 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.27 
 
 
339 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.18 
 
 
339 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.27 
 
 
339 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  32.11 
 
 
419 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  32.11 
 
 
419 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  32.56 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.63 
 
 
637 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.77 
 
 
419 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.07 
 
 
403 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  30.49 
 
 
101 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  31.73 
 
 
415 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
419 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  27.85 
 
 
101 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  31.19 
 
 
421 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  30.93 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  32.1 
 
 
124 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  26.19 
 
 
248 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  27.42 
 
 
652 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  30.1 
 
 
415 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  26.51 
 
 
100 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>