152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2443 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  100 
 
 		 143 aa  298  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  37.84 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  36.94 
 
 		 166 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  35.16 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  35.35 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  35.79 
 
 		 194 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  34.02 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  40 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  33.65 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 395 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  33.94 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  33.04 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  32.14 
 
 		 499 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.96 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  30.95 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 393 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  31.82 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  38.82 
 
 		 632 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 631 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  38.1 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 647 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  28.42 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  40.24 
 
 		 636 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  34.07 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  30.1 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.27 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.27 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  28 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  40.24 
 
 		 647 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  31.96 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.72 
 
 		 653 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  35.29 
 
 		 632 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  24.65 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.03 
 
 		 477 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  27.59 
 
 		 394 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  32.18 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  28.46 
 
 		 546 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  27.1 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  25.13 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  27.18 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.22 
 
 		 645 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  28.16 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  32 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  37.35 
 
 		 649 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  32.53 
 
 		 633 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.8 
 
 		 637 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 271 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  26.53 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  25 
 
 		 388 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  25 
 
 		 388 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 657 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  38.37 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.95 
 
 		 298 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  29.57 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  36.59 
 
 		 644 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  34.94 
 
 		 275 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.67 
 
 		 433 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  23.76 
 
 		 200 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  26.53 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  26.47 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6353  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  31.33 
 
 		 652 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  34.94 
 
 		 664 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  27.52 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  30.61 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5825  hypothetical protein  30.93 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  32.22 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  26.56 
 
 		 296 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  26.74 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  31 
 
 		 705 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  25.52 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  26.85 
 
 		 286 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  29.93 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  31.76 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  32.35 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.71 
 
 		 498 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>