203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1391 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  100 
 
 		 151 aa  318  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  86.01 
 
 		 143 aa  264  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  86.01 
 
 		 143 aa  264  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  36.99 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  39.86 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  38.89 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6117  cytochrome c protein CopJ  38.79 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0965626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  37.9 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3596  hypothetical protein  40.18 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.705754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0189  putative cytochrome c class I  43.88 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  36.3 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0522  hypothetical protein  40.74 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  39.6 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1575  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2114  cytochrome c, class I  36.27 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  30.16 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  27.82 
 
 		 419 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  35.54 
 
 		 395 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0440  cytochrome c class I  28.79 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00184102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  28.21 
 
 		 432 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  31.2 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.31 
 
 		 403 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.05 
 
 		 440 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.48 
 
 		 418 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  30.69 
 
 		 438 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.35 
 
 		 419 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 419 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  30 
 
 		 391 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 429 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 420 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.53 
 
 		 403 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.65 
 
 		 430 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.1 
 
 		 429 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.35 
 
 		 420 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  26 
 
 		 388 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.68 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30.33 
 
 		 388 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 419 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30.33 
 
 		 388 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.53 
 
 		 403 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 419 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.65 
 
 		 430 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.65 
 
 		 426 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.57 
 
 		 447 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 683 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  27.08 
 
 		 450 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  27.72 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.65 
 
 		 430 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 427 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.04 
 
 		 447 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 448 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.04 
 
 		 447 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 537 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.12 
 
 		 453 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1907  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 411 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0184  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  32 
 
 		 571 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  30.83 
 
 		 644 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  30 
 
 		 649 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  26.09 
 
 		 432 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  29 
 
 		 463 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.53 
 
 		 403 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.53 
 
 		 395 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  34.69 
 
 		 415 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  28 
 
 		 350 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  31.52 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  27.12 
 
 		 421 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.64 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  26.96 
 
 		 430 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  29.01 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  34.69 
 
 		 415 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30 
 
 		 474 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.76 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  30.36 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  25.64 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.64 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  25.62 
 
 		 432 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  25.64 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.85 
 
 		 498 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.62 
 
 		 432 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  27.35 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  27.52 
 
 		 466 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  25.22 
 
 		 430 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>