35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0526 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  52.33 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  45.73 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  43.79 
 
 		 176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  39.77 
 
 		 178 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  41.32 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  44.85 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  37.99 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  43.7 
 
 		 603 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  36.69 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  43.24 
 
 		 499 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  38.89 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  37.89 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  32.93 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  32.73 
 
 		 175 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  36.09 
 
 		 477 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  32.34 
 
 		 175 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  32.56 
 
 		 175 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  34.52 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  33.33 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  26.47 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  30.86 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  31.55 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  26.04 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  29.19 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  26.04 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  26.9 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  23.81 
 
 		 624 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  22.62 
 
 		 624 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  25.61 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  29.52 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  26.36 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  28.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  22.75 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  32.65 
 
 		 172 aa  42  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.164665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>