38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5953 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  39.88 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  41.42 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  41.76 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  39.23 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  41.82 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  38.6 
 
 		 477 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  40.85 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  39.16 
 
 		 217 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  42.76 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  40.69 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  37.28 
 
 		 499 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  39.41 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.69 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.69 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  36.69 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  37.57 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  34.12 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  43.26 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  40.69 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  43.33 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  38.97 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  35.56 
 
 		 674 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  30.71 
 
 		 624 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  30.92 
 
 		 624 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  28.75 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  32.61 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2774  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  31.16 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.164665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  29.1 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  25.75 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  28.97 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1813  hypothetical protein  34.55 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  31.09 
 
 		 603 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>