86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1042 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 674 aa  1325    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  41.2 
 
 		 445 aa  344  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  38.65 
 
 		 466 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  39.63 
 
 		 454 aa  320  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  40.79 
 
 		 448 aa  319  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  36.27 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  37.75 
 
 		 451 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  37.05 
 
 		 478 aa  310  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  37.56 
 
 		 463 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  40.22 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  38.34 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  38.34 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  37.45 
 
 		 486 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  37.47 
 
 		 478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  37.74 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  37.31 
 
 		 456 aa  296  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  38.41 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  37.18 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  37.23 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  38.46 
 
 		 472 aa  290  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  34.36 
 
 		 466 aa  286  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  31.42 
 
 		 593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  37.05 
 
 		 471 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  38.57 
 
 		 451 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  37.02 
 
 		 476 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  28.91 
 
 		 603 aa  278  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  33.7 
 
 		 493 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  33.96 
 
 		 484 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  33.41 
 
 		 490 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  38.65 
 
 		 456 aa  264  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  30.87 
 
 		 494 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  31.62 
 
 		 624 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  31.77 
 
 		 624 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  33.19 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  32.16 
 
 		 476 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  30.84 
 
 		 451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  35.19 
 
 		 666 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  32.38 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  31.42 
 
 		 472 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  35.09 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  35 
 
 		 642 aa  200  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  30.27 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  30.56 
 
 		 448 aa  176  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  34.5 
 
 		 180 aa  97.4  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  32.58 
 
 		 181 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  33.52 
 
 		 181 aa  88.2  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  27.93 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  32.73 
 
 		 192 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  28.06 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  28.11 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  44.33 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  29.73 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  35.56 
 
 		 186 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  36.03 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  28.84 
 
 		 413 aa  67  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  46.48 
 
 		 158 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  34.72 
 
 		 172 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  28.93 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  34.72 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  26.69 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  30.25 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  29.65 
 
 		 477 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  32.35 
 
 		 175 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  31.62 
 
 		 175 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.54 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  31.62 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  36.62 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  32.54 
 
 		 176 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.72 
 
 		 414 aa  56.2  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  31.2 
 
 		 175 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  22.25 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  23.63 
 
 		 435 aa  54.3  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  27.11 
 
 		 217 aa  53.9  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  47.06 
 
 		 172 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.6 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  25.15 
 
 		 408 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  45.61 
 
 		 172 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.164665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  22.05 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  21.17 
 
 		 383 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  28.81 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  26.34 
 
 		 417 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  27.5 
 
 		 389 aa  45.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  25.48 
 
 		 422 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  27.97 
 
 		 384 aa  43.9  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>