31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5667 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  358  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  62.43 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  48.21 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  40.35 
 
 		 178 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  41.32 
 
 		 197 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  39.53 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  38.37 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  43.61 
 
 		 603 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  33.92 
 
 		 217 aa  97.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  31.07 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  35.33 
 
 		 499 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  30.67 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  30.77 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  31.4 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  30.18 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  28.82 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  30.54 
 
 		 477 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  27.54 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  31.85 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  29.94 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  27.33 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  24.85 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  27.93 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  23.21 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  27.03 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  27.71 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  34 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  29.1 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  22.75 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  24.65 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  25.73 
 
 		 624 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>