38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1593 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  56.98 
 
 
181 aa  184  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  52.6 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  52.54 
 
 
192 aa  180  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  50.29 
 
 
192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  49.12 
 
 
217 aa  167  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  46.3 
 
 
180 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  43.37 
 
 
477 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  44.12 
 
 
499 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  39.44 
 
 
180 aa  134  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  43.2 
 
 
175 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  37.65 
 
 
172 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  41.82 
 
 
186 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  37.65 
 
 
172 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  42.01 
 
 
175 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  42.6 
 
 
175 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  42.01 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  40.48 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  42.01 
 
 
176 aa  117  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  38.69 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  45.58 
 
 
158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  35.67 
 
 
175 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  31.71 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  30.67 
 
 
177 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  30.46 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  32.94 
 
 
674 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  27.17 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  30.52 
 
 
624 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  30.38 
 
 
624 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  29.79 
 
 
603 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  24.71 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  44.83 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.164665 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1873  hypothetical protein  25.95 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.152497  normal  0.709122 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2553  hypothetical protein  39.73 
 
 
145 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>