30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1637 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  363  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  71.43 
 
 
177 aa  274  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  53.03 
 
 
603 aa  160  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  45.18 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  44.85 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  39.66 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  38.37 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  33.9 
 
 
178 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  31.64 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  30.68 
 
 
477 aa  79  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  31.65 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  28.9 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  26.04 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  32 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  30.23 
 
 
499 aa  71.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  28.16 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  28.16 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  27.18 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  24.71 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  25.57 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  29.31 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  27.19 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  28.16 
 
 
172 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  32.74 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  26.55 
 
 
175 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  28.57 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  27.18 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  29.91 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  24.58 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>