37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4185 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  55.03 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  52.63 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  52.63 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  50.88 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  54.17 
 
 		 175 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  56.29 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  40.48 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  37.28 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  32.93 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  35.76 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  35.76 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  40.29 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  43.36 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  37.42 
 
 		 175 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  33.73 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  39.72 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.2 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.2 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  45.76 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  34.97 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  30.72 
 
 		 499 aa  84  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.74 
 
 		 477 aa  78.2  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  26.82 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.164665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  26.79 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  26.47 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  41.3 
 
 		 674 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  25.29 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2553  hypothetical protein  43.62 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  25.57 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  24.85 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  29.14 
 
 		 624 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  22.49 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  29.45 
 
 		 624 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01300  hypothetical protein  22.67 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  27.45 
 
 		 603 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>