25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2553 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  43.62 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  35.64 
 
 		 624 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  31.9 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.7 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  36.7 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  32.11 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  27.83 
 
 		 477 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  34.86 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  27.54 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  31.29 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  31.47 
 
 		 181 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  33.66 
 
 		 624 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  29.33 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2774  hypothetical protein  39.73 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  28.99 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  35.65 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  32.29 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  26.23 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  26.23 
 
 		 192 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  35.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  25.69 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  32.86 
 
 		 499 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  23.45 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>