203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3248 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  100 
 
 		 143 aa  303  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  100 
 
 		 143 aa  303  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  86.01 
 
 		 151 aa  240  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  42.75 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2780  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  40.98 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  40.98 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2192  cytochrome c class I  42.99 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6117  cytochrome c protein CopJ  40 
 
 		 174 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0965626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3596  hypothetical protein  40.35 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.705754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0189  putative cytochrome c class I  44.9 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3786  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117464  normal  0.511619 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4062  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1741  cytochrome c, class I  39.2 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  39.6 
 
 		 171 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 196 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0522  hypothetical protein  38.14 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1575  cytochrome c, class I  39 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2114  cytochrome c, class I  37 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0440  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00184102  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 469 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  34.71 
 
 		 395 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  27.43 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 683 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  30.63 
 
 		 429 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 419 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.67 
 
 		 403 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.06 
 
 		 403 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.35 
 
 		 403 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  28.24 
 
 		 388 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.35 
 
 		 420 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 448 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.72 
 
 		 447 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.72 
 
 		 447 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  27.66 
 
 		 450 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  28.44 
 
 		 463 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 429 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.72 
 
 		 453 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.57 
 
 		 419 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  29.36 
 
 		 438 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.06 
 
 		 403 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.35 
 
 		 420 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 420 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  32.41 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.35 
 
 		 474 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.37 
 
 		 537 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 361 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.12 
 
 		 447 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.19 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  32.77 
 
 		 394 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 708 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.24 
 
 		 530 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  30.33 
 
 		 721 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  34.02 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.37 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3207  cytochrome c class I  30 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.565348  decreased coverage  0.00513342 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  30.33 
 
 		 694 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  33.67 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  34.02 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  33.67 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  29 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  26.13 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.27 
 
 		 726 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 391 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.7 
 
 		 430 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.47 
 
 		 395 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  30.61 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 527 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  28.28 
 
 		 429 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 554 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.59 
 
 		 430 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 527 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  28.85 
 
 		 427 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  30.53 
 
 		 644 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.7 
 
 		 426 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.16 
 
 		 429 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.66 
 
 		 432 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  35.45 
 
 		 571 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.66 
 
 		 432 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  29.51 
 
 		 721 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  25.74 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  25.66 
 
 		 432 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.72 
 
 		 498 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>