46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1596 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1596  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0850  hypothetical protein  68.18 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1593  hypothetical protein  44.03 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3734  hypothetical protein  41.75 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  37.76 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  36.26 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  35.87 
 
 		 269 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5245  cytochrome c class I  30.11 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.87 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  38.55 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  30.68 
 
 		 291 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  29.21 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  29.21 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.9 
 
 		 304 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  28.71 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  29.21 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.46 
 
 		 205 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.83 
 
 		 321 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  31.11 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  29.21 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  29.55 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 381 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  31.13 
 
 		 248 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  32.14 
 
 		 209 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.23 
 
 		 546 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 203 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  31.85 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.25 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.46 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  30.53 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  35.96 
 
 		 304 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  28.28 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.7 
 
 		 332 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.14 
 
 		 311 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>