30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2508 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  100 
 
 		 150 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  47.62 
 
 		 188 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  47.42 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4058  cytochrome c class I  37.75 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3782  cytochrome c class I  37.75 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637528  normal  0.789636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1744  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  55.17 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  44.19 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  34.34 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 313 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.18 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 313 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.32 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.31 
 
 		 313 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.31 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  33.98 
 
 		 621 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.72 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  29.47 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  56.25 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.43 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  50 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 404 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  53.12 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  45.45 
 
 		 269 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  46.67 
 
 		 308 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.36 
 
 		 602 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>