29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3782 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4058  cytochrome c class I  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3782  cytochrome c class I  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637528  normal  0.789636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1744  cytochrome c, class I  50.41 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  46.09 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  48.86 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  50 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 133 aa  87.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.82 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  31.82 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  31.5 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  27.45 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  30.93 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  37.23 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 		 392 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  29.07 
 
 		 557 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1479  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.98 
 
 		 287 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1660  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.98 
 
 		 287 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0290388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 238 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1833  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.98 
 
 		 287 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  31.33 
 
 		 307 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.68 
 
 		 602 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.71 
 
 		 293 aa  40.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>