42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1744 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1744  cytochrome c, class I  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3782  cytochrome c class I  50.41 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637528  normal  0.789636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4058  cytochrome c class I  50.41 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  45.99 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  44.03 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  42.14 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  45.98 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  32.63 
 
 		 419 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  28.07 
 
 		 479 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  32.71 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  30.93 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  32.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 527 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 527 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 143 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 143 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 101 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  35.05 
 
 		 476 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  30 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.25 
 
 		 602 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  24.83 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  24.83 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  24.83 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 546 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 524 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  42.22 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.86 
 
 		 587 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.22 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 537 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  27.06 
 
 		 278 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  30.59 
 
 		 149 aa  40  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  25.88 
 
 		 277 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>