51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0105 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  50 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  55.17 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1744  cytochrome c, class I  44.07 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3782  cytochrome c class I  41.84 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637528  normal  0.789636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4058  cytochrome c class I  41.84 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  46.24 
 
 		 188 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3330  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36.17 
 
 		 291 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.92 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.42 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.5 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  31.36 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  48.89 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.89 
 
 		 432 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.89 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.08 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  30.08 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 381 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  32.74 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  27.59 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.46 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 152 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.58 
 
 		 469 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  31.58 
 
 		 252 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  36.36 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.67 
 
 		 425 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 427 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  25.42 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.93 
 
 		 308 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.71 
 
 		 1023 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  27.73 
 
 		 190 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  31.76 
 
 		 272 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  27.73 
 
 		 190 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>