15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3973 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  47.42 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  42.65 
 
 
188 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1744  cytochrome c, class I  54.64 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3782  cytochrome c class I  48.86 
 
 
152 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637528  normal  0.789636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4058  cytochrome c class I  48.86 
 
 
152 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  36.56 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  43.75 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  32.14 
 
 
410 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  29.63 
 
 
136 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  56.25 
 
 
394 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  56.25 
 
 
394 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  51.72 
 
 
664 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  44.12 
 
 
647 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  32.5 
 
 
284 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>