75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1020 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  65.29 
 
 
461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  57.02 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  56.49 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.82 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  55.76 
 
 
452 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  57.99 
 
 
450 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  57.08 
 
 
489 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  53.24 
 
 
454 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  51.67 
 
 
462 aa  356  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.85 
 
 
479 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  53.3 
 
 
460 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  54.28 
 
 
455 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  51.91 
 
 
461 aa  349  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  54.34 
 
 
464 aa  348  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  52.03 
 
 
465 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  56.3 
 
 
361 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.68 
 
 
459 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.48 
 
 
464 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  52.36 
 
 
459 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  51.56 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  55.01 
 
 
435 aa  339  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  56.8 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.53 
 
 
478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  57.82 
 
 
557 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  53.44 
 
 
493 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  55.26 
 
 
446 aa  335  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  51.13 
 
 
466 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.1 
 
 
468 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  59.43 
 
 
496 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  50.23 
 
 
454 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  51.66 
 
 
441 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  51.46 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  46.99 
 
 
505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  52.88 
 
 
439 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  51.91 
 
 
457 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  52.24 
 
 
464 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  50.11 
 
 
432 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  51.12 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  56.12 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  46.67 
 
 
473 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.86 
 
 
462 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  48.8 
 
 
476 aa  292  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  47.56 
 
 
477 aa  289  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  49.02 
 
 
433 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  49.22 
 
 
448 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.5 
 
 
483 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.24 
 
 
509 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  39.82 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.9 
 
 
477 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.3 
 
 
481 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  33.63 
 
 
523 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.84 
 
 
532 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  38.27 
 
 
501 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.88 
 
 
477 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.36 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  46.51 
 
 
840 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  40.4 
 
 
673 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  53.85 
 
 
168 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.86 
 
 
530 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.46 
 
 
541 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.25 
 
 
2160 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.42 
 
 
759 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.52 
 
 
767 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.62 
 
 
558 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  26.39 
 
 
523 aa  50.4  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 
593 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  29.17 
 
 
987 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  34.19 
 
 
717 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  24.53 
 
 
1359 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  24.02 
 
 
863 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  37.69 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  26.87 
 
 
1023 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.04 
 
 
575 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  42.55 
 
 
362 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>