80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1229 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  938    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  46.06 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  49.29 
 
 		 509 aa  333  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  47.51 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  45.74 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  46.47 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  41.25 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.55 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  38.01 
 
 		 465 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.9 
 
 		 479 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  40.41 
 
 		 459 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  36.83 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  38.34 
 
 		 461 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  35.7 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.54 
 
 		 523 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  39.9 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  37.68 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  37.47 
 
 		 461 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  35.32 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  34.91 
 
 		 483 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.4 
 
 		 464 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  36.52 
 
 		 459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  34.51 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  36.65 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  36.62 
 
 		 455 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  38.87 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  39.24 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.18 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  37.34 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  40.46 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  36.42 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  37.69 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  36.97 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.92 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  39.79 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.99 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  38.36 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  36.77 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  36.77 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  36.12 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  37.92 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  35.73 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  36.01 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  34.96 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  35.71 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  35.35 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  37.01 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  39.39 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  36.97 
 
 		 557 aa  156  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  37.99 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  34.62 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  39.02 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  35.37 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  33.54 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  38.83 
 
 		 673 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  38.38 
 
 		 840 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.62 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.13 
 
 		 767 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.73 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  33.22 
 
 		 2160 aa  64.7  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.6 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.44 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  28.67 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  30.33 
 
 		 1037 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  35.77 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.92 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.47 
 
 		 2192 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  30.18 
 
 		 558 aa  47  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  32.74 
 
 		 1755 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  29.26 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  26.07 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1010 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  26.22 
 
 		 852 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  24.89 
 
 		 1296 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.32 
 
 		 1800 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  24.79 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.75 
 
 		 863 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.03 
 
 		 527 aa  43.5  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>