84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3987 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  905    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  62.29 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  74.03 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  65.25 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  65.14 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  60.37 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  60.55 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  64.54 
 
 		 557 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.2 
 
 		 479 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  58.02 
 
 		 452 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  59 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  56.54 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  58.49 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  57.72 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  59.14 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  56.63 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  57.98 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  58.04 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  52.04 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.6 
 
 		 464 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  57.23 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  55.88 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  52.94 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  54.05 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  54.93 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.32 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  58.08 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  52.6 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  53.18 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  51.59 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.07 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  54.24 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  57.64 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  52.61 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  52.53 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  54.07 
 
 		 462 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  54.89 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  55.42 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.91 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  51.27 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  56.54 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  48.76 
 
 		 476 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  60.69 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  51.56 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  50.31 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  48.12 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.79 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  37.13 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  40.05 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.63 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  42.13 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.28 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.06 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.24 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.95 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.36 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  40.89 
 
 		 840 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  39.15 
 
 		 673 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  46.43 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.93 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  32.12 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.2 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.45 
 
 		 1296 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  39.29 
 
 		 1037 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.33 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  35.52 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.63 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.31 
 
 		 863 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.8 
 
 		 601 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  41.12 
 
 		 2160 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.61 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  28.14 
 
 		 1332 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.64 
 
 		 575 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  29.9 
 
 		 1092 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  38.97 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1318 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  28.12 
 
 		 1359 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.29 
 
 		 558 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1263 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1106 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.24 
 
 		 593 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.56 
 
 		 575 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  39.39 
 
 		 294 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.53 
 
 		 2192 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>