67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2803 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 527 aa  1015    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  33.02 
 
 		 541 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  31.96 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  29.44 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  31.61 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  27.87 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  33.71 
 
 		 852 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  29.66 
 
 		 591 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30 
 
 		 1318 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.72 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.94 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.17 
 
 		 2160 aa  64.3  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  28.49 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  30.82 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  28.84 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  31.21 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  27.97 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  31.14 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  27.74 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.53 
 
 		 767 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.69 
 
 		 465 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  28.34 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.74 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  30.56 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  33.17 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  28.33 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  31.33 
 
 		 593 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  26.07 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.71 
 
 		 2192 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  25.54 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  26.56 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.95 
 
 		 523 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  30.17 
 
 		 2042 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  26.41 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  26.91 
 
 		 454 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  24.92 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  32.17 
 
 		 507 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  29.55 
 
 		 526 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  26.4 
 
 		 460 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  24.81 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.69 
 
 		 1296 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  25.18 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.13 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  26.79 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  21.86 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.05 
 
 		 1252 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 913 aa  47.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  26.27 
 
 		 450 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.85 
 
 		 464 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  25.2 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 		 817 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  26.7 
 
 		 775 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1061 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.51 
 
 		 1234 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  29.51 
 
 		 1234 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  30.36 
 
 		 1234 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.78 
 
 		 863 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  29.8 
 
 		 415 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  29.51 
 
 		 1250 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  29.51 
 
 		 1250 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  27.96 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.71 
 
 		 462 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  24.75 
 
 		 454 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  38.04 
 
 		 1332 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.58 
 
 		 479 aa  43.9  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  30.59 
 
 		 834 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  42.55 
 
 		 504 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>