14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2313 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1699    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  35.71 
 
 		 987 aa  240  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  36.08 
 
 		 842 aa  181  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1003 aa  166  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1023 aa  97.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.37 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  24.92 
 
 		 665 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  38.55 
 
 		 2192 aa  47.8  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  24.85 
 
 		 483 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  27.23 
 
 		 461 aa  45.8  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1061 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1361  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  45.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  25.71 
 
 		 659 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  30.59 
 
 		 527 aa  44.3  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>