79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1120 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 441 aa  854    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  56.79 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.11 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  58.39 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.19 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  59.17 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  52.48 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.51 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  54.24 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  52.68 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  54.67 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.04 
 
 		 462 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  53.8 
 
 		 467 aa  358  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  53.78 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  54.04 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  56.22 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  57.95 
 
 		 361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  54.83 
 
 		 493 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  53.99 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  49.28 
 
 		 505 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  50.9 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.32 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  54.95 
 
 		 477 aa  345  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  51.43 
 
 		 489 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.78 
 
 		 478 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.12 
 
 		 459 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  53.85 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  51.24 
 
 		 466 aa  335  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  50.55 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.23 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  54.3 
 
 		 557 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  53.3 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  52.1 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  55.01 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  51.42 
 
 		 496 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  50.11 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  53.11 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  49.89 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  48.21 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.95 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  49.36 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  52.32 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  49.34 
 
 		 462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  52.25 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  48.2 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  46.21 
 
 		 448 aa  235  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.31 
 
 		 509 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.9 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.94 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  39.79 
 
 		 481 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  42.62 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.6 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.14 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.51 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.58 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.97 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  49.17 
 
 		 840 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  49.15 
 
 		 673 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  42.14 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.82 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  25.78 
 
 		 601 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  34.39 
 
 		 717 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.75 
 
 		 852 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.07 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.02 
 
 		 1296 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.52 
 
 		 362 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.19 
 
 		 541 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  24.46 
 
 		 759 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  33.98 
 
 		 1359 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.31 
 
 		 572 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  40 
 
 		 1332 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1023 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.55 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.35 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  29.59 
 
 		 1037 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24 
 
 		 884 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  26.79 
 
 		 2160 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  49.09 
 
 		 294 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.35 
 
 		 863 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>