119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2873 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 717 aa  1358    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  71.98 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  46.13 
 
 		 362 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  38.74 
 
 		 558 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  36.82 
 
 		 1010 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  32.04 
 
 		 1106 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  35.65 
 
 		 575 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 2192 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  37.56 
 
 		 272 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  35.62 
 
 		 575 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  37.37 
 
 		 541 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  31.57 
 
 		 545 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  30.59 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  32.09 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  34.91 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  37.56 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  29.6 
 
 		 601 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  35.53 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  30.72 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.03 
 
 		 1037 aa  78.2  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  33.69 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  41.06 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  30.8 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  33.49 
 
 		 913 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.44 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  36.07 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.36 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  38.41 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  33.65 
 
 		 454 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  32.08 
 
 		 509 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  39.46 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.23 
 
 		 1755 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  35.45 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  32.72 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  30.04 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  36.09 
 
 		 454 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.21 
 
 		 759 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  36.36 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.11 
 
 		 852 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  35.15 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  42.02 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  37.85 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  32.92 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.6 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  29.32 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  31.3 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 		 3066 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.76 
 
 		 2042 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  30.82 
 
 		 659 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  37.16 
 
 		 450 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.13 
 
 		 464 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.58 
 
 		 478 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  33.68 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  38.74 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.03 
 
 		 1296 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  32.47 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  38.51 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  31.8 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  38.79 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  52.22 
 
 		 1716 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  40.8 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  32.16 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  40 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  32.05 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  39.19 
 
 		 1619 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  34.62 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  38.3 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.94 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  38.55 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  30.45 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.58 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  32.81 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  37.82 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  33.19 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  42.64 
 
 		 523 aa  56.6  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  29.85 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  38.84 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  30.29 
 
 		 655 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  35.21 
 
 		 863 aa  54.7  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  32.4 
 
 		 817 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  31.97 
 
 		 743 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  37.44 
 
 		 2160 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  37.27 
 
 		 441 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.84 
 
 		 1197 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  29.63 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  36.49 
 
 		 527 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  32.29 
 
 		 476 aa  51.6  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  27.98 
 
 		 647 aa  51.2  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  34.51 
 
 		 459 aa  51.2  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 384 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1023 aa  50.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.8 
 
 		 530 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.15 
 
 		 462 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  31.49 
 
 		 572 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  28.24 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  39.55 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  33.85 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  33.62 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>