66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1468 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1020    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1467  hypothetical protein  77.27 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.66201  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  32.26 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.87 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  28.19 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  31.48 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0136  hypothetical protein  30.05 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1003 aa  60.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.95 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  35.27 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  28.82 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  30.21 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.77 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  29.82 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  26.75 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.27 
 
 		 465 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  33.16 
 
 		 501 aa  57  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.07 
 
 		 2160 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  27.7 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  30.48 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  26.58 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  31.58 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  31.58 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.28 
 
 		 852 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  30.06 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  38.89 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  32.21 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  35.71 
 
 		 646 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.15 
 
 		 884 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  42.03 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.69 
 
 		 1296 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  31.07 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  25.85 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  31.18 
 
 		 361 aa  54.3  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.76 
 
 		 479 aa  54.3  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  38.41 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.91 
 
 		 2192 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  29.58 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  28.84 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  38.1 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  28.93 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  40.71 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  31.54 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  29.94 
 
 		 527 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  40.62 
 
 		 362 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1318 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  27.63 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  25.93 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  31.22 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  36.94 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.39 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  27.83 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1010 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  31.58 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  34.74 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.93 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  31.36 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.07 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  30.82 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.58 
 
 		 530 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  31.71 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.85 
 
 		 1281 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  37 
 
 		 294 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.82 
 
 		 863 aa  43.9  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 541 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>