82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4375 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 465 aa  916    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  66.88 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  61.46 
 
 		 454 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  67.25 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  64.32 
 
 		 455 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  59.66 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  63.14 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.3 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  60.52 
 
 		 460 aa  461  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  59.79 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  58.13 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  56.18 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.15 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  57.08 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  61.57 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  65.67 
 
 		 361 aa  435  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  59.29 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  61.94 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  55.03 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  57.27 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  57.93 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.14 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.84 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  59.3 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  54.24 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  56.76 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  55.97 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  53.89 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  49.02 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  58.35 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  52.3 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  57.42 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  54.56 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.62 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  53.09 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.16 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  55.6 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  57.17 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.75 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  57.2 
 
 		 473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.05 
 
 		 464 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  52.28 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  48.41 
 
 		 439 aa  335  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.26 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  56.42 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  49.9 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.89 
 
 		 476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  44.42 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.27 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  39.91 
 
 		 532 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  40.12 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  40.52 
 
 		 483 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  36.93 
 
 		 523 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  41.5 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.81 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.15 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.21 
 
 		 673 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  41.95 
 
 		 840 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  46.9 
 
 		 168 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.4 
 
 		 759 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.63 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.45 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.86 
 
 		 1037 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.94 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  34.27 
 
 		 523 aa  57  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.9 
 
 		 767 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  40.62 
 
 		 362 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.76 
 
 		 1296 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.31 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  28.03 
 
 		 2160 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.82 
 
 		 1332 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.59 
 
 		 601 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.18 
 
 		 1755 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  34.09 
 
 		 717 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  40.31 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.52 
 
 		 884 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.2 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1106 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45402  predicted protein  29.17 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1318 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.85 
 
 		 575 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.39 
 
 		 575 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>