51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2726 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 593 aa  1179    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.28 
 
 		 601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  29.03 
 
 		 593 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.01 
 
 		 575 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.03 
 
 		 558 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.04 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  26.51 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1010 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.83 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1106 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  28.36 
 
 		 659 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.5 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.76 
 
 		 2192 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  25.96 
 
 		 913 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  40.34 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  39.17 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.15 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.7 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.4 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.84 
 
 		 2042 aa  60.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  30.04 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  26.65 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  25.45 
 
 		 530 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  35.84 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  30.48 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  26.54 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.7 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  27.98 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  35.4 
 
 		 362 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  26.67 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  26.36 
 
 		 665 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.28 
 
 		 759 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  26.49 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  28.4 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  27.23 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  31.06 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  25.62 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  26.29 
 
 		 433 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  32.7 
 
 		 462 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  26.37 
 
 		 459 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  30.58 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.2 
 
 		 465 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  31.58 
 
 		 731 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.59 
 
 		 523 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  24.66 
 
 		 852 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  60 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.05 
 
 		 1197 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  27.65 
 
 		 647 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  26.94 
 
 		 450 aa  43.9  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  26.24 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>