82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3075 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 462 aa  895    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  65.61 
 
 		 464 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  63.08 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  64.64 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  61.6 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  61.61 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.64 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  55.41 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.56 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  55.36 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  55.44 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  54.04 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  53.42 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  54.45 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.81 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  55.56 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  56.75 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  52.49 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  53.35 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.91 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  56.48 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  49.46 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  50.85 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  50.3 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  52.03 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  51.33 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.47 
 
 		 462 aa  339  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  53.46 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  57.22 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  47.1 
 
 		 505 aa  335  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  51.99 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  49.79 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  49.1 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  50.11 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  51.59 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  53.56 
 
 		 448 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  52.16 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.82 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  50.69 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  53.03 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  48.2 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.11 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  45.7 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  50.9 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  48.67 
 
 		 441 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  48.45 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.69 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.35 
 
 		 483 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.91 
 
 		 481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.02 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  34.82 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  37.78 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  37.15 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.86 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.27 
 
 		 673 aa  103  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  39.15 
 
 		 840 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.34 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  32.7 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  33.48 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.94 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  30.93 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  26.71 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.17 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  33.01 
 
 		 558 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  42.72 
 
 		 362 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  30.45 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.17 
 
 		 1296 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.7 
 
 		 884 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  33.56 
 
 		 1755 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.41 
 
 		 852 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  24.61 
 
 		 575 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.68 
 
 		 2160 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  29.34 
 
 		 527 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  42.03 
 
 		 294 aa  47  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1106 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  25.85 
 
 		 1359 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  28.92 
 
 		 1092 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1318 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  31.01 
 
 		 1619 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>